Es un proyecto cultural que nació el año 2000 bajo la tutela de Machupicchu y otros pueblos del Valle Sagrado de los Inkas, con el auspicio institucional de la Asamblea Nacional de Rectores ANR, en el marco del Decenio Internacional de los Pueblos Indígenas y con motivo del advenimiento del presente milenio. Su objetivo es promocionar la red vial Inka (Qhapac Ñan) y las culturas prehispánicas que se desarrollaron en el antiguo Tawantinsuyo, bajo el liderazgo de sus pueblos herederos.
Por su vocación de crecimiento, Ruta Inka ha ingresado a una nueva era institucional liderada por nuestra comunidad universitaria, sobretodo luego de la suscripción de un Convenio de Cooperación con el Consejo Nacional del Educación Superior del Ecuador - CONESUP en el año 2004.